Mehmet Kaplan har bland annat bjudit in den kände antisemiten Yvonne Ridley till Sveriges riksdag i samband med ett seminarium arrangerat av det egna partiet. Han förklarade senare med att han ”brustit i omdöme”. Han har även seglat med ”Ship to Gaza”. I samband med Gazakriget, 2014, syntes han med Hamashalsduk och talade bland annat om att ”befria Jerusalem”.
”Det är sant att jag vid ett tillfälle befunnit mig i samma rum som en antisemit. Jag var dessutom delansvarig för att personen befann sig där. Men de minuterna i mitt liv, hur pinsamma de än är, är givetvis inte det som definierar mig som person. Att påstå att hela mitt livs kamp mot rasism varit en lögn och dessa minuter då jag befann mig fyra meter från en rasist var sanningen är faktiskt, ursäkta uttrycket, så korkat så klockorna stannar”, skrev Mhemet Kaplan på Expressen debatt gällande sin invit till Yvonne Ridley.
I söndags framkom att Mehmet Kaplan, på ett filmat seminarium i mars 2009, jämförde Israels agerande mot palestinier med hur judarna förföljdes av nazisterna under 1930-talet. Ministern har starka kopplingar till flera organisationer som Muslimska brödraskapet har inflytelse i och har bland annat varit ordförande i den muslimska rättighetsföreningen Charta 2008.
I förra veckan avslöjades att Mehmet Kaplan, 2015, åt middag med islamister och Ilhan Senturk, ordföranden för den ultranationalistiska organisationen Grå vargarna. Organisationen ligger bland annat bakom attacker mot kurder i Tyskland.
Det har även avslöjats att Mehmet Kaplan under flera år har haft nära kontakt med Rafet Candemir, miljöpartist från Skärholmen i Stockholm, som är utsedd att jobba för Turkiet i rådet för turkiska medborgare utomlands, bland annat genom att ha kontakt med Mehmet Kaplan. Rådet rapporterar direkt till premiärministerns kontor i Turkiet och har flera gånger haft möten med den högsta politiska ledningen i landet. President Erdoğan har tidigare hyllats för att ha demokratiserat landet, men de senaste åren har hans politik innehållit allt mer konservativ islam, skriver SVT.
Mehmet Kaplan har tidigare kritiserats för att ha bagatelliserat att svenska muslimer reser till Syrien och Irak för att bli jihadister genom att jämföra dem med frivilliga under finska vinterkriget, vid ett seminarium i Almedalen 2014.
När Imamen Ali Berzengi, som dömdes för terroristbrott 2005, på nytt fick anmälningsplikt hos polisen i maj förra året, drev Mehmet Kaplan att han skulle benådas och få permanent uppehållstillstånd, vilket han inte längre vill kommentera.
I debatten om Muhammedbilderna, i Jyllands-Posten 2006, menade Mehmet Kaplan att den danska tidningen hade gått över gränsen, vilket senare har kritiserats.
Flera debattörer har under Mehmet Kaplans tid i regeringen varnat för hans relationer med islamitiska grupper i Sverige och Turkiet. En av dem är Nalin Pekgul, tidigare ordförande för socialdemokratiska kvinnoförbundet, som i en debattartikel i Di, i oktober 2014, varnade för utnämningen av Mehmet Kaplan som minister i regeringen.
Mehmet Kaplan som är född den 18 juli 1971 i Turkiet var sekreterare (1996–2000) och ordförande (2000–2002) för Sveriges Unga Muslimer. Han blev sedermera presstalesman för Sveriges muslimska råd (2005–2006). 16 mars 2008 var Mehmet Kaplan med och grundade den islamiska organisationen Svenska Muslimer för Fred och Rättvisa.